アラヤ、光学神経機能データ解析用ソフトウエア(OptiNiSt)の拡張機能を開発
2023年11月16日（木）15時16分 PR TIMES
研究用ソフトウエア、データベース開発を行う株式会社アラヤ（所在地：東京都千代田区、代表取締役：金井 良太、以下「アラヤ」）は、光学神経科学機能解析を行うGUIベースソフトウエアツール「OptiNiSt(*1)」のユーザー体験を向上させる拡張機能を開発しました。
[画像1: https://prtimes.jp/i/49573/22/resize/d49573-22-e5e2b8a068afeaa25f8d-0.png ]
本件は国立開発研究法人日本医療研究開発機構(所在地：東京都千代田区、理事長：三島 良直、以下「AMED」)の革新脳プロジェクトのもと、沖縄科学技術大学院大学（沖縄県国頭郡、学長兼理事長：カン・マルキデス、以下「OIST」）の神経計算ユニット と国立大学法人東京大学（東京都文京区、総長：藤井 輝夫、以下「東京大学」）の大木研究室より業務委託を受け開発に至りました。
アラヤでは今後も研究DXの支援を通じて、より研究に集中できる環境づくりを支援してまいります。
n 拡張機能の概要
1. マルチユーザー対応
認証、ユーザー管理を追加
データ共有が可能
2. ワークフローセッションの復元
ワークフロー実行中にリロードしても自動的に復元される仕様に改善
3. NWBファイルでのアルゴリズム識別
複数の同種のアルゴリズムを利用した際に、それらの結果を識別可能に改善
4. imaging rateのグローバル設定とその活用
imaging rateに関連するパラメータを1パイプライン内でグローバルに設定し、パラメータ編集の手間を軽減
imaging rateを利用したTime Courseのプロットの単位変換を実装
[画像2: https://prtimes.jp/i/49573/22/resize/d49573-22-55152fca181fd3ce3ec5-2.png ]
▼ OptiNiStのダウンロードはこちら（無料）▼
ドキュメント: https://optinist.readthedocs.io/en/latest/index.html
GitHub: https://github.com/oist/optinist/releases/tag/v1.0.0
Python Package Index: https://pypi.org/project/optinist/
Docker Hub: https://hub.docker.com/r/oistncu/optinist
*1: OptiNiSt(Optical Neuroimage Studio)は、研究者が行った複数のデータ解析結果を可視化したり、データ解析パイプラインを簡単かつ迅速に構築したりすることを支援するソフトウエアです。研究結果の再現性、解析プロトコルの標準化、新規解析ツールの追加を行うことも可能です。
*2: NWB(Neurodata Without Borders)は神経生理学分野で使用される標準的なデータ形式です。（詳細：https://www.nwb.org/ ）
・アラヤの目指す未来
アラヤはオープンサイエンスとデータ駆動型研究等の推進研究活動の実現のため、アラヤの強みである脳神経科学分野をはじめとした様々な分野で研究データの管理・利活用、ネットワーク・計算資源の整備等を進めてまいります。本事例のような研究DX支援を通じて研究に集中できる環境を整え、様々な分野での研究成果創出を促進することを目指しております。
[画像3: https://prtimes.jp/i/49573/22/resize/d49573-22-e2f90a9c5596333bef47-2.png ]
・アラヤとは
アラヤは人工知能（AI）やアルゴリズム開発をコア技術として、様々な業界で事業を展開しています。アラヤには実装経験豊富なエンジニアと、国内外のM.D.やPh.D. 修士号保有の研究者が在籍しており、研究環境のシステム開発に際し「かゆいところに手が届く」支援が可能です。
本案件をはじめとして、アラヤではAIや脳研究のナレッジを活用したソリューション開発やソフトウエア/パイプライン開発を承っています。お気軽にご相談ください。
【会社概要】
会社名：株式会社アラヤ
代表者：代表取締役 金井 良太
設 立：2013年12月
所在地：東京都千代田区神田佐久間町1-11 産報佐久間ビル6F
ＵＲＬ：https://www.araya.org/
事 業：ディープラーニング、エッジAI、自律AI、ニューロテック、研究受託
お問い合わせURL:https://www.araya.org/contact
[画像1: https://prtimes.jp/i/49573/22/resize/d49573-22-e5e2b8a068afeaa25f8d-0.png ]
本件は国立開発研究法人日本医療研究開発機構(所在地：東京都千代田区、理事長：三島 良直、以下「AMED」)の革新脳プロジェクトのもと、沖縄科学技術大学院大学（沖縄県国頭郡、学長兼理事長：カン・マルキデス、以下「OIST」）の神経計算ユニット と国立大学法人東京大学（東京都文京区、総長：藤井 輝夫、以下「東京大学」）の大木研究室より業務委託を受け開発に至りました。
アラヤでは今後も研究DXの支援を通じて、より研究に集中できる環境づくりを支援してまいります。
n 拡張機能の概要
1. マルチユーザー対応
認証、ユーザー管理を追加
データ共有が可能
2. ワークフローセッションの復元
ワークフロー実行中にリロードしても自動的に復元される仕様に改善
3. NWBファイルでのアルゴリズム識別
複数の同種のアルゴリズムを利用した際に、それらの結果を識別可能に改善
4. imaging rateのグローバル設定とその活用
imaging rateに関連するパラメータを1パイプライン内でグローバルに設定し、パラメータ編集の手間を軽減
imaging rateを利用したTime Courseのプロットの単位変換を実装
[画像2: https://prtimes.jp/i/49573/22/resize/d49573-22-55152fca181fd3ce3ec5-2.png ]
▼ OptiNiStのダウンロードはこちら（無料）▼
ドキュメント: https://optinist.readthedocs.io/en/latest/index.html
GitHub: https://github.com/oist/optinist/releases/tag/v1.0.0
Python Package Index: https://pypi.org/project/optinist/
Docker Hub: https://hub.docker.com/r/oistncu/optinist
*1: OptiNiSt(Optical Neuroimage Studio)は、研究者が行った複数のデータ解析結果を可視化したり、データ解析パイプラインを簡単かつ迅速に構築したりすることを支援するソフトウエアです。研究結果の再現性、解析プロトコルの標準化、新規解析ツールの追加を行うことも可能です。
*2: NWB(Neurodata Without Borders)は神経生理学分野で使用される標準的なデータ形式です。（詳細：https://www.nwb.org/ ）
・アラヤの目指す未来
アラヤはオープンサイエンスとデータ駆動型研究等の推進研究活動の実現のため、アラヤの強みである脳神経科学分野をはじめとした様々な分野で研究データの管理・利活用、ネットワーク・計算資源の整備等を進めてまいります。本事例のような研究DX支援を通じて研究に集中できる環境を整え、様々な分野での研究成果創出を促進することを目指しております。
[画像3: https://prtimes.jp/i/49573/22/resize/d49573-22-e2f90a9c5596333bef47-2.png ]
・アラヤとは
アラヤは人工知能（AI）やアルゴリズム開発をコア技術として、様々な業界で事業を展開しています。アラヤには実装経験豊富なエンジニアと、国内外のM.D.やPh.D. 修士号保有の研究者が在籍しており、研究環境のシステム開発に際し「かゆいところに手が届く」支援が可能です。
本案件をはじめとして、アラヤではAIや脳研究のナレッジを活用したソリューション開発やソフトウエア/パイプライン開発を承っています。お気軽にご相談ください。
【会社概要】
会社名：株式会社アラヤ
代表者：代表取締役 金井 良太
設 立：2013年12月
所在地：東京都千代田区神田佐久間町1-11 産報佐久間ビル6F
ＵＲＬ：https://www.araya.org/
事 業：ディープラーニング、エッジAI、自律AI、ニューロテック、研究受託
お問い合わせURL:https://www.araya.org/contact
